З 1996 г.на базе Інстытута систэмных даследаванняў у АПК НАН Беларусі не радзей як два разы на год праводзяцца міжнародныя навукова-практычныя канферэнцыі па пытаннях устойлівага развіцця сельскай гаспадаркі, міжнароднай інтэграцыі ў аграрнай сферы, забеспячэння харчовай бяспекі, развіцця бізнесу ў аграрным сектары і інш. Ініцыятарамі правядзення выступаюць Аддзяленне аграрных навук Нацыянальнай акадэміі навук Беларусі і Інстытут сістэмных даследаванняў у АПК НАН Беларусі.
У працы канферэнцый прымаюць удзел прадстаўнікі навукова-даследчых арганізацый Расійскай акадэміі навук, Акадэміі сельскагаспадарчых навук Рэспублікі Казахстан, Украінскай акадэміі аграрных навук, Польшчы, Еўразійскай эканамічнай камісіі і іншых замежных арганізацый, а таксама Нацыянальнай акадэміі навук Беларусі, Міністэрства сельскай гаспадаркі і харчавання Рэспублікі Беларусь, вышэйшых навучальных устаноў і іншых арганізацый і ведамстваў краіны.
З 1996 г. па цяперашні час арганізаваны і праведзены наступныя міжнародныя навукова-практычныя канферэнцыі:
1996 г. – Міжнародная навукова-практычная канферэнцыя «Аграэканамічная палітыка канца XX стагоддзя: сучасная сітуацыя і стратэгія ў будучыні», прысвечаная 40-годдзю інстытута (18–19 снежня 1996 г.);
1998 г. – Міжнародная навукова-практычная канферэнцыя «Эканамічныя праблемы аграпрамысловага комплексу» (15–16 кастрычніка 1998 г.);
2000 г. – Міжнародная навукова-практычная канферэнцыя «Урокі аграрных рэформаў і перспектывы развіцця эканомікі сельскай гаспадаркі» (1–3 чэрвеня 2000 г.);
2002 г. – Міжнародная навукова-практычная канферэнцыя «Рэфармаванне аграпрамысловага комплексу: праблемы і шляхі іх рашэнняў» (12–14 чэрвеня 2002 г.);
2004 г. – V Міжнародная навукова-практычная канферэнцыя «Дзяржаўнае рэгуляванне і рынкавае развіццё АПК» (26–28 мая 2004 г.);
2006 г. – VI Міжнародная навукова-практычная канферэнцыя «Задачы і перспектывы АПК у кантэксце Праграмы адраджэння і развіцця вёскі», прысвечаная 50-годдзю Інстытута (28−29 верасня 2006 г.);
2008 г. – VII Міжнародная навукова-практычная канферэнцыя «Актуальныя праблемы ўстойлівасці развіцця сельскай гаспадаркі» (17−18 верасня 2008 г.);
2010 г. – VIII Міжнародная навукова-практычная канферэнцыя «Развіццё АПК у кантэксце забеспячэння харчовай бяспекі» (9–10 верасня 2010 г.);
2012 г. – IХ Міжнародная навукова-практычная канферэнцыя «Устойлівае развіццё сельскай гаспадаркі Беларусі ў новых умовах» (20 верасня 2012 г.);
2014 г. – Х Міжнародная навукова-практычная канферэнцыя «АПК Беларусі: найноўшыя выклікі рэгіянальнай і міжнароднай інтэграцыі» (4–5 верасня 2014 г.);
2016 г. – Першы Усебеларускі форум па харчовай бяспецы (12 кастрычніка 2016 г.)
2016 г. – XI Міжнародная навукова-практычная канферэнцыя «Развіццё бізнесу ў аграрным сектары эканомікі Рэспублікі Беларусь» (13–14 кастрычніка 2016 г.);
2018 г. – XII Міжнародная навукова-практычная канферэнцыя «Актуальныя праблемы ўстойлівага развіцця аграпрамысловага комплексу» (11–12 кастрычніка 2018 г.);
2020 г. – XIII Міжнародная навукова-практычная канферэнцыя «Забеспячэнне якасці прадукцыі АПК ва ўмовах рэгіянальнай і міжнароднай інтэграцыі» (15–16 кастрычніка 2020 г.).
2021 г. – XIV Міжнародная навукова-практычная канферэнцыя «Павышэнне эфектыўнасці буйнатаварнай вытворчасці і прадпрымальніцтва ў новых умовах гаспадарання», прысвечаная 65-годдзю Інстытута сістэмных даследаванняў у АПК Нацыянальнай акадэміі навук Беларусі (14–15 кастрычніка 2021 г.).
2022 г. – XV Міжнародная навукова-практычная канферэнцыя «Канкурэнтаздольнасць і эфектыўнасць АПК у кантэксце аптымізацыі матэрыяльна-тэхнічнага і фінансавага забеспячэння» (13–14 кастрычніка 2022 г.).
2023 г. – Рэспубліканскі семінар «Сацыяльна-працоўныя адносіны ў АПК: механізмы мадэрнізацыі» (20 красавіка 2023 г.)
2023 г. – Рэспубліканскі навукова-практычны семінар «Забеспячэнне якасці і бяспекі прадукцыі АПК» (25 мая 2023 г.)
2023 г. – Круглы стол «Харчовая бяспека Рэспублікі Беларусь: новыя выклікі і магчымасці», прымеркаваны да Сусветнага дня харчавання» (18 кастрычніка 2023 г.)
2024 г. – Круглы стол «Развіццё механізму збыту сельскагаспадарчай прадукцыі і харчавання ў найноўшых умовах» (28 лютага 2024 г.)
2024 г. – Круглы стол «Фарміраванне і развіццё разумных сістэм у тэорыі і практыцы сельскай гаспадаркі» (18 красавіка 2024 г.)
2024 г. – Круглы стол «Эканамічны патэнцыял эфектыўнай і ўстойлівай жывёлагадоўлі Рэспублікі Беларусь» (12 чэрвеня 2024 г.)
2024 г. – XVI Міжнародная навукова-практычная канферэнцыя «Эканамічная незалежнасць аграпрамысловага комплексу ў новых умовах» (17-18 кастрычніка 2024 г.)
